舰队驻守是保护资源点和战略要地的核心机制。有效驻守需要合理配置舰队、利用建筑加成、掌握指令机制以及协调同盟支援。
优先选择装甲型战舰作为前排，搭配中后排输出舰船，确保舰队具备持续作战能力。支援型舰船如卫士级驱逐舰可提供维修和防空支援，建议优先加点雷达锁定速度和冷却缩减，以提升治疗频率和生存能力。大型舰船如战列巡洋舰和航母需搭配护卫舰保护，避免被敌方小型舰船集火。技术值分配应侧重护甲、能量抗性和关键武器系统，以强化舰队整体防御。
在城市或资源点周边建立前哨站可快速迁移基地，实现即时增援。采矿平台等建筑形成的方形计划圈不计入计划上限，可扩展控制范围。高等级城市自带防卫舰队，实力与城市等级挂钩，合理利用可减轻玩家驻守压力。资源带附近建立基地既能开采高级矿物，又能承担驻守任务，但需确保驻扎玩家具备足够战力。
指令机制的正确使用能优化驻守效果。驻守指令会优先攻击采集或进攻资源的敌人，适合防守固定目标。封锁指令可覆盖整个计划圈，自动攻击途经敌方舰队，但消耗策略值较高，需谨慎使用。增援指令能以极快速度补充战力，适合应对突发袭击。曲率航行可缩短支援时间，但需确保目标区域存在己方建筑或舰队。撤退指令可保留受损舰船，避免全军覆没。
高等级城市应以同盟主力驻防为主，小城市为辅，避免兵力分散。通过集结指令可统一指挥多支舰队，适合大规模防御战。情报共享能提前预判敌方行动，针对性调整布防。演习可测试防御漏洞，优化舰队搭配和战术。劣势局面下，可集中航母等核心舰船撤离至安全区域，减少损失。
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